傳統熱萃取是以熱傳導、熱輻射等方式由外向里進行,即能量首先無規則地傳遞給萃取劑,再由萃取劑擴散進基體物質,然后從基體中溶解或夾帶出多種成分出來,即遵循加熱—滲透進基體—溶解或夾帶—滲透出來的模式,因此萃取的選擇性較差;而微波萃取是通過離子遷移和偶極子轉動兩種方式里外同時加熱,能對體系中的不同組分進行選擇性加熱,使目標組分直接從基體中分離。
與傳統提取方法相比,微波萃取有巨大的優勢,主要體現在:選擇性高,可以提高收率及提取物質純度,快速高效,節能,節省溶劑,污染小,質量穩定,有利于萃取對熱不穩定的物質,可以避免長時間的高溫引起樣品的分解,特別適合處理熱敏性組分或從天然物質中提取有效成分,同時可實行多份試樣同時處理,也特別適合處理大批量樣品。
與超臨界萃取相比,微波萃取的儀器設備比較簡單,投資小,且適用面廣,較少受被萃取物質極性的限制(目前超臨界流體萃取難以應用于極性較強的物質)。與超聲萃取法相比,微波萃取具有快速、節省溶劑、提取效率高等優點,而超聲萃取一般需要重復萃取才能將有效成分萃取完全。